Sekolah Menengah Pertama Katolik (SMPK) Sang Timur didirikan pada awal Januari 1967 dan berlokasi di Jl. Bandung No. 2 Malang, menempati lahan seluas kurang lebih 1.200 m². Kehadirannya bertujuan menjawab kebutuhan pendidikan masyarakat Malang, khususnya sebagai kelanjutan bagi lulusan SD Sang Timur Malang serta sekolah dasar di sekitarnya. Pada awal berdirinya, sekolah ini hanya menerima siswa putri hingga tahun 1976 dan dikenal dengan nama Sekolah Menengah Pertama Katolik Putri Sang Timur. Seiring adanya dukungan dari Pemerintah Kota Malang, baik dalam bentuk sarana maupun tenaga pengajar (DPK), nama sekolah berubah menjadi Sekolah Menengah Pertama Katolik Berbantuan Sang Timur. Sejak tahun 1977, sekolah mulai menerima siswa putra sebagai wujud pembauran. Pada tahun 1985, SMPK Sang Timur berhasil meraih status terakreditasi “Disamakan” dan mampu mempertahankannya hingga tahun 1991. Kepemimpinan sekolah diawali oleh Bapak B.M. Sarseno (1967), dilanjutkan oleh Sr. Regina (alm) (1968), dan Sr. Immaculata PIJ (1969).

Dalam perjalanannya, SMPK Sang Timur tetap setia mengemban misi pendidikan Sang Timur, yaitu membimbing anak-anak dan kaum muda semakin dekat dengan Tuhan melalui pendampingan yang intensif, baik dalam aspek mental-spiritual, kepribadian, maupun intelektual, sehingga terbentuk pribadi yang utuh (integral). Kekhasan sekolah ini tercermin dalam budaya kasih persaudaraan, kegembiraan, kesederhanaan, kedisiplinan, sikap reflektif, serta kreativitas. Hubungan yang akrab antara guru dan siswa, perhatian yang besar terhadap perkembangan setiap siswa—termasuk mereka yang menghadapi tantangan akademik maupun sosial—serta kehidupan religius yang menjadi pembiasaan utama, semakin memperkuat identitas SMPK Sang Timur.

Sebagai sekolah multikultural, SMPK Sang Timur terbuka bagi siswa dari berbagai latar belakang suku, ras, agama, dan sosial ekonomi. Nilai penghargaan terhadap martabat pribadi menjadi dasar terciptanya suasana kekeluargaan yang mampu merangkul perbedaan. Keunggulan sekolah ini terletak pada pendidikan karakter yang terintegrasi dalam seluruh kegiatan pembelajaran dan ekstrakurikuler, guna membentuk generasi yang berintegritas dan berkarakter. Selain itu, SMPK Sang Timur Malang juga dikenal sebagai pelopor pendidikan kewirausahaan di Kota Malang dan di lingkungan Yayasan Karya Sang Timur, sebagai upaya menumbuhkan sikap kreatif, inovatif, mandiri, tangguh, serta bertanggung jawab dalam menghadapi berbagai tantangan kehidupan.