Sekolah Menengah Pertama Katolik (SMPK) Sang Timur didirikan pada awal Januari 1967, berlokasi di Jl. Bandung 2 Malang dan menempati lahan kurang lebih 1.200 m². Sekolah Menengah Pertama Katolik (SMPK) Sang Timur didirikan untuk menjawab kebutuhan pendidikan masyarakat Malang, secara khusus menampung para lulusan SD Sang Timur Malang yang telah berdiri lebih dahulu dan Sekolah-Sekolah Dasar sekitar lingkungan Sang Timur.

Semula SMPK Sang Timur ini hanya menerima siswa putri sampai dengan tahun 1976. Oleh karena semula bernama : Sekolah Menengah Pertama Katolik Putri Sang Timur.

Dengan adanya rencana Pemerintah Kota Malang untuk memberi bantuan, maka  SMPK Putri Sang Timur juga mendapatkan bantuan baik sarana maupun tenaga pengajar (Dpk) sehingga berubah nama menjadi Sekolah Menengah Pertama Katolik Berbantuan Sang Timur. Sejak tahun 1977 SMPK Berbantuan Sang Timur menerima siswa putra sebagai langkah pembauran siswa.

Pada Tahun 1985 SMPK Sang Timur terakreditasi dan mendapat status Disamakan. Demikian pula pada tahun 1991, SMPK Sang Timur dapat mempertahankan status Disamakan.

Kepala Sekolah pertama adalah Bapak B.M. Sarseno (1967), dilanjutkan oleh Sr. Regina (alm) (1968) dan Sr. Immaculata PIJ (1969).

Dalam perkembangannya, SMPK Sang Timur tetap konsisten dalam mengemban misi Sang Timur dalam upaya membawa anak-anak dan kaum muda kepada Tuhan. Pendampingan siswa intensif untuk membentuk mental –spiritual, kepribadian dan intelektual menjadi manusia yang utuh  (integral).

Hal yang khas di SMPK Sang Timur adalah: budaya kasih persaudaraan, kegembiraan dan kesederhanaan, disiplin, reflektif, kreatif. Keakraban antara siswa dengan guru sangat dirasakan oleh warga sekolah, perhatian terhadap siswa sangat besar terlebih kepada siswa yang bermasalah dalam akademik, kepribadian/sosial. Kehidupan religius sangat diperhatikan dan merupakan pembiasaan yang utama.

SMPK Sang Timur merupakan sekolah yang multikultural yaitu dengan menerima siswa dari berbagai suku, ras, agama, latar belakang, strata keluarga. Asas penghargaan terhadap martabat- pribadi menjadi dasar rasa kekeluargaan yang dapat meretas berbagai perbedaan yang ada.

Keunggulan SMPK Sang Timur adalah pendidikan karakter yang terintegrasi dalam semua mata pelajaran, dalam kegiatan ekstrakurikuler dalam rangka  menyiapkan dan membekali generasi muda bangsa agar menjadi pribadi yang berintegritas tinggi, berkarakter.

Selain itu SMPK Sang Timur Malang menjadi perintis dalam pendidikan entrepreneurship di kota Malang dan di kalangan sekolah–sekolah di bawah naungan Yayasan Karya Sang Timur, sebagai salah satu upaya pembentukan karakter: kreatif, inovatif, mandiri dan bertanggungjawab, tangguh mengadapi kesulitan, serta memiliki daya juang.